W programie Comarch Betterfly dokumenty dodane w menu Faktury i zatwierdzone na stałe są automatycznie przenoszone do ewidencji księgowych w menu Księgowość. Dokumenty handlowe, wystawione przez podatnika zwolnionego z VAT, są przenoszone na następujące listy:
Po przeniesieniu dokumentu do Ewidencji przychodów/kosztów lub Rejestru sprzedaży/zakupów pozycje z dokumentu pierwotnego są sumowane do jednej względem wybranego rodzaju: towar lub usługa.